MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 38253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012815	CG	4	8	223	230	0 %	0 %	50 %	50 %	241195473
2	NC_012815	GGCT	2	8	236	243	0 %	25 %	50 %	25 %	241195473
3	NC_012815	GGT	2	6	265	270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195473
4	NC_012815	CAC	2	6	274	279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195473
5	NC_012815	GC	3	6	351	356	0 %	0 %	50 %	50 %	241195473
6	NC_012815	GCC	2	6	406	411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195473
7	NC_012815	GGA	2	6	445	450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195473
8	NC_012815	GCC	2	6	482	487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195473
9	NC_012815	GCG	3	9	563	571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195473
10	NC_012815	CGA	2	6	610	615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195473
11	NC_012815	GCA	2	6	658	663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195473
12	NC_012815	ACG	2	6	681	686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195473
13	NC_012815	CAC	2	6	751	756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195473
14	NC_012815	CGC	2	6	771	776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195473
15	NC_012815	GTTC	2	8	792	799	0 %	50 %	25 %	25 %	241195473
16	NC_012815	CGG	2	6	961	966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195473
17	NC_012815	CG	3	6	1038	1043	0 %	0 %	50 %	50 %	241195473
18	NC_012815	CGAG	2	8	1056	1063	25 %	0 %	50 %	25 %	241195473
19	NC_012815	ACGA	2	8	1070	1077	50 %	0 %	25 %	25 %	241195473
20	NC_012815	TGC	2	6	1164	1169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195473
21	NC_012815	CGA	2	6	1174	1179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195473
22	NC_012815	CGG	2	6	1192	1197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195473
23	NC_012815	TTC	2	6	1220	1225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195473
24	NC_012815	GCC	2	6	1282	1287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195473
25	NC_012815	GGA	2	6	1297	1302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195473
26	NC_012815	GCC	2	6	1357	1362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195473
27	NC_012815	ACG	2	6	1428	1433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195473
28	NC_012815	CAA	2	6	1462	1467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241195473
29	NC_012815	CT	3	6	1513	1518	0 %	50 %	0 %	50 %	241195473
30	NC_012815	ACC	2	6	1521	1526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195473
31	NC_012815	CAC	2	6	1573	1578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195473
32	NC_012815	CAT	2	6	1603	1608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195473
33	NC_012815	CG	4	8	1609	1616	0 %	0 %	50 %	50 %	241195473
34	NC_012815	CGA	2	6	1642	1647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195473
35	NC_012815	GCC	2	6	1662	1667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195473
36	NC_012815	CG	3	6	1710	1715	0 %	0 %	50 %	50 %	241195473
37	NC_012815	CGG	2	6	1756	1761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195473
38	NC_012815	ACCAC	2	10	1767	1776	40 %	0 %	0 %	60 %	241195473
39	NC_012815	CATG	2	8	1780	1787	25 %	25 %	25 %	25 %	241195473
40	NC_012815	AGC	2	6	1866	1871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195473
41	NC_012815	TTCG	2	8	2512	2519	0 %	50 %	25 %	25 %	241195474
42	NC_012815	GAC	2	6	2536	2541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195474
43	NC_012815	ACGC	2	8	2553	2560	25 %	0 %	25 %	50 %	241195474
44	NC_012815	GGC	2	6	2596	2601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195474
45	NC_012815	CG	4	8	2644	2651	0 %	0 %	50 %	50 %	241195474
46	NC_012815	CGT	2	6	2686	2691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195474
47	NC_012815	GCT	2	6	2704	2709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195474
48	NC_012815	TGC	2	6	2727	2732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195474
49	NC_012815	GAC	2	6	2764	2769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195474
50	NC_012815	CCGGC	2	10	2784	2793	0 %	0 %	40 %	60 %	241195474
51	NC_012815	CGA	2	6	3037	3042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195474
52	NC_012815	GCG	2	6	3059	3064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195474
53	NC_012815	CCGTT	2	10	3097	3106	0 %	40 %	20 %	40 %	241195474
54	NC_012815	CCG	2	6	3216	3221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195474
55	NC_012815	TGG	2	6	3306	3311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195474
56	NC_012815	AACGC	2	10	3315	3324	40 %	0 %	20 %	40 %	241195474
57	NC_012815	CGGC	2	8	3366	3373	0 %	0 %	50 %	50 %	241195474
58	NC_012815	GAC	2	6	3508	3513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195474
59	NC_012815	GCA	2	6	3541	3546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195474
60	NC_012815	GAG	2	6	3560	3565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195474
61	NC_012815	TCG	2	6	3777	3782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195475
62	NC_012815	TCG	2	6	3840	3845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195475
63	NC_012815	GCC	2	6	3863	3868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195475
64	NC_012815	CG	3	6	3872	3877	0 %	0 %	50 %	50 %	241195475
65	NC_012815	AGA	2	6	3883	3888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195475
66	NC_012815	ACA	2	6	3909	3914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241195475
67	NC_012815	GAC	2	6	3934	3939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195475
68	NC_012815	CGG	2	6	3991	3996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195475
69	NC_012815	TCG	2	6	4038	4043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195475
70	NC_012815	CGA	2	6	4054	4059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195475
71	NC_012815	CGTT	2	8	4094	4101	0 %	50 %	25 %	25 %	241195475
72	NC_012815	GCC	2	6	4112	4117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195475
73	NC_012815	CG	3	6	4178	4183	0 %	0 %	50 %	50 %	241195475
74	NC_012815	AGG	2	6	4209	4214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195475
75	NC_012815	GAG	2	6	4229	4234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195475
76	NC_012815	GC	3	6	4235	4240	0 %	0 %	50 %	50 %	241195475
77	NC_012815	CGT	2	6	4407	4412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195475
78	NC_012815	CGA	2	6	4414	4419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195475
79	NC_012815	GGC	2	6	4477	4482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195475
80	NC_012815	GAC	2	6	4556	4561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195475
81	NC_012815	TCG	2	6	4601	4606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195475
82	NC_012815	CGCTGG	2	12	4623	4634	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241195475
83	NC_012815	TCT	2	6	4657	4662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195475
84	NC_012815	GTG	2	6	4691	4696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195475
85	NC_012815	CGA	2	6	4699	4704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195475
86	NC_012815	CGT	2	6	4730	4735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195475
87	NC_012815	ATC	2	6	4775	4780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195475
88	NC_012815	GCG	2	6	4787	4792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195475
89	NC_012815	GCCCAT	2	12	4823	4834	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241195475
90	NC_012815	GGC	2	6	4846	4851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195475
91	NC_012815	GGC	2	6	4871	4876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195475
92	NC_012815	GCCG	2	8	4906	4913	0 %	0 %	50 %	50 %	241195475
93	NC_012815	GCC	2	6	4937	4942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195475
94	NC_012815	GCAT	2	8	4968	4975	25 %	25 %	25 %	25 %	241195475
95	NC_012815	GCAG	2	8	4976	4983	25 %	0 %	50 %	25 %	241195475
96	NC_012815	GAGC	2	8	5085	5092	25 %	0 %	50 %	25 %	241195475
97	NC_012815	GCCG	2	8	5133	5140	0 %	0 %	50 %	50 %	241195476
98	NC_012815	GAG	2	6	5200	5205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195476
99	NC_012815	CGA	2	6	5235	5240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195476
100	NC_012815	GTT	2	6	5256	5261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241195476
101	NC_012815	CGCA	2	8	5352	5359	25 %	0 %	25 %	50 %	241195476
102	NC_012815	TGGG	2	8	5365	5372	0 %	25 %	75 %	0 %	241195476
103	NC_012815	CGT	2	6	5414	5419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195476
104	NC_012815	TGC	2	6	5441	5446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195476
105	NC_012815	GCAA	2	8	5543	5550	50 %	0 %	25 %	25 %	241195476
106	NC_012815	CAAC	2	8	5786	5793	50 %	0 %	0 %	50 %	241195477
107	NC_012815	CGATC	2	10	5830	5839	20 %	20 %	20 %	40 %	241195477
108	NC_012815	ACG	2	6	5874	5879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195477
109	NC_012815	GAC	2	6	5888	5893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195477
110	NC_012815	ACG	2	6	5913	5918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195477
111	NC_012815	CAC	2	6	6005	6010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195477
112	NC_012815	TCG	2	6	6024	6029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195477
113	NC_012815	CGA	2	6	6112	6117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195477
114	NC_012815	CGA	2	6	6136	6141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195477
115	NC_012815	CGG	2	6	6196	6201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195477
116	NC_012815	CGG	4	12	6208	6219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195477
117	NC_012815	CGG	2	6	6232	6237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195477
118	NC_012815	GGT	2	6	6259	6264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195477
119	NC_012815	CG	3	6	6279	6284	0 %	0 %	50 %	50 %	241195477
120	NC_012815	CTA	2	6	6310	6315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195477
121	NC_012815	CGA	3	9	6379	6387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195477
122	NC_012815	GAC	2	6	6436	6441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195477
123	NC_012815	GCA	2	6	6465	6470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195477
124	NC_012815	CAG	2	6	6476	6481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195477
125	NC_012815	CGA	2	6	6535	6540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195477
126	NC_012815	GC	3	6	6542	6547	0 %	0 %	50 %	50 %	241195477
127	NC_012815	CGGCGA	2	12	6559	6570	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241195477
128	NC_012815	GGA	2	6	6580	6585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195477
129	NC_012815	CCA	2	6	6792	6797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195477
130	NC_012815	GGC	2	6	6803	6808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195477
131	NC_012815	GAG	2	6	6815	6820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195477
132	NC_012815	CG	3	6	6827	6832	0 %	0 %	50 %	50 %	241195477
133	NC_012815	CAAAGA	2	12	6880	6891	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	241195477
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135	NC_012815	AGACGA	2	12	6975	6986	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	241195477
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143	NC_012815	CGAG	2	8	7215	7222	25 %	0 %	50 %	25 %	241195477
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169	NC_012815	CG	3	6	8288	8293	0 %	0 %	50 %	50 %	241195478
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258	NC_012815	CGA	2	6	11378	11383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195479
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261	NC_012815	ACC	2	6	11655	11660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195480
262	NC_012815	CGA	2	6	11746	11751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195480
263	NC_012815	TTCA	2	8	11807	11814	25 %	50 %	0 %	25 %	241195480
264	NC_012815	TGC	2	6	11841	11846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195480
265	NC_012815	TGA	2	6	11853	11858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195480
266	NC_012815	CGT	2	6	11860	11865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195480
267	NC_012815	GCT	2	6	11943	11948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195480
268	NC_012815	TCGACG	2	12	12015	12026	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241195480
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270	NC_012815	GAA	2	6	12097	12102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195480
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273	NC_012815	CTG	2	6	12338	12343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195480
274	NC_012815	TTC	2	6	12470	12475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195480
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278	NC_012815	GCT	2	6	12535	12540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195480
279	NC_012815	TCT	2	6	12543	12548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195480
280	NC_012815	AAG	2	6	12557	12562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195480
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282	NC_012815	AAT	2	6	12664	12669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241195480
283	NC_012815	GC	4	8	12753	12760	0 %	0 %	50 %	50 %	241195481
284	NC_012815	GCA	2	6	12765	12770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195481
285	NC_012815	CCA	2	6	12771	12776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195481
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287	NC_012815	GCC	2	6	12805	12810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195481
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289	NC_012815	TGG	2	6	12930	12935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195481
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292	NC_012815	GTT	2	6	13117	13122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241195481
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294	NC_012815	CGT	2	6	13197	13202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195481
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374	NC_012815	TTCGA	2	10	17127	17136	20 %	40 %	20 %	20 %	241195485
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380	NC_012815	GAC	2	6	17310	17315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195485
381	NC_012815	TGGC	2	8	17348	17355	0 %	25 %	50 %	25 %	241195485
382	NC_012815	CAA	2	6	17393	17398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241195485
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385	NC_012815	GATC	2	8	17549	17556	25 %	25 %	25 %	25 %	241195485
386	NC_012815	GGA	2	6	17591	17596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195485
387	NC_012815	CCG	2	6	17620	17625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195485
388	NC_012815	AGG	2	6	17644	17649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195485
389	NC_012815	TTCC	2	8	17722	17729	0 %	50 %	0 %	50 %	241195485
390	NC_012815	ACCGA	2	10	17784	17793	40 %	0 %	20 %	40 %	241195485
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497	NC_012815	GC	4	8	25214	25221	0 %	0 %	50 %	50 %	241195492
498	NC_012815	GAT	2	6	25250	25255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195492
499	NC_012815	CGACG	2	10	25256	25265	20 %	0 %	40 %	40 %	241195492
500	NC_012815	CGA	2	6	25316	25321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195492

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